Vacanze estive
Finalmente Greymon!
Gomamon, che è in grado di parlare con le creature acquatiche, fa in modo che i pesci presenti nel fiume del burrone salvino i ragazzi ed i loro Digimon, mentre Kuwagamon cade anch'egli nel fiume. Il gruppo viene portato a riva e prova ad individuare la propria posizione, cercando poi un modo per tornare a casa. Agumon rivela ai ragazzi che loro sono i primi esseri umani a mettere piede a Digiworld. Tai conduce il gruppo verso l'oceano, dove trovano diverse cabine telefoniche sulla spiaggia. Mentre il gruppo si riposa per decidere il proprio piano d'azione, subisce l'attacco da parte di uno Shellmon. Nessuno dei Digimon, eccetto Agumon, dispone della forza necessaria a combattere a causa della mancanza di cibo (Agumon ha infatti mangiato dei biscotti che TK e Joe avevano nei propri zaini). Tai viene catturato da Shellmon ed a quel punto Agumon digievolve improvvisamente in Greymon e scaglia Shellmon nell'oceano.
Una notte indimenticabile
Il gruppo lascia la spiaggia e si ritrova nel bel mezzo di una lotta fra due Monochromon. I ragazzi riescono a fuggire indenni e, mentre il cielo sopra Digiworld si scurisce, si imbattono in un tram vicino ad un lago. Recuperato un po' di pesce per la cena, il gruppo stabilisce dei turni di guardia per la notte, ma Tai e Matt litigano su chi dei due dovrebbe fare il primo turno. Durante il primo turno, Tai risveglia inavvertitamente un Seadramon quando, per errore, scaglia un ramoscello infuocato sulla sua coda. Seadramon spinge il tram verso il centro del lago e cattura Matt. Gabumon digivolve in Garurumon e sconfigge Seadramon. Bambini e Digimon crollano tutti esausti dopo il combattimento.
Sora in pericolo
L'avventura continua...
Il gruppo si imbatte in una strana fabbrica, dove trovano un Andromon intrappolato all'interno di alcuni macchinari. Dopo averlo liberato, il Digimon improvvisamente li attacca. Izzy nel frattempo scopre degli strani codici, grazie ai quali riesce a causare la Digievoluzione di Tentomon in Kabuterimon. Kabuterimon, con l'aiuto di Greymon e Garurumon, distrugge l'Ingranaggio Nero che controlla Andromon. Scusandosi per il suo comportamento, Andromon mostra ai ragazzi la strada per raggiungere l'area successiva.
Ora tocca a te, Palmon!
Mentre stanno scappando da alcuni Numemon che avevano precedentemente attaccato il gruppo nelle fogne, attraverso le quali stava lasciando la fabbrica, i bambini vengono divisi e Mimi finisce nella Città dei Balocchi dopo essere stata attaccata da Monzaemon. Una volta lì, la ragazza scopre che gli altri ragazzi si comportano in maniera strana, mentre gli altri Digimon sono prigionieri all'interno di un baule. Palmon riesce a digievolvere in Togemon e distrugge l'Ingranaggio Nero che controlla Monzaemon, liberando così gli altri ragazzi dall'attacco del Digimon che li aveva fatti comportare in modo così strano.[Note 2]
La furia di Gomamon
Il gruppo giunge ai piedi del Monte Mugen, ma Tai e Matt litigano sulla decisione di scalarlo o meno, con il primo convinto di doverlo fare così da tracciare una cartina della zona intorno a loro, mentre il secondo è fermo nel ritenere che sia troppo pericoloso. Infine, il gruppo sceglie di rimandare la decisione al giorno successivo, ma Joe e Gomamon decidono di scalare la montagna da soli durante la notte. Mentre si trovano sul Monte, i due vengono attaccati da Unimon. Tai e Sora arrivano ad aiutare gli amici, ma Gomamon riesce improvvisamente a digievolvere Ikkakumon e a distruggere l'Ingranaggio Nero che controlla Unimon. Il gruppo al completo si ritrova sulla vetta della montagna, scoprendo però di essere su un'isola nell'oceano, l'Isola di File.
Devimon, messaggero delle tenebre
I ragazzi finalmente incontrano colui che trama di impossessarsi dell'isola di File: si tratta di Devimon, capace di controllare gli Ingranaggi Neri. Il Digimon, insieme ad Ogremon e ad un Leomon controllato da un Ingranaggio Nero, attacca il gruppo, che però riesce a scappare. I ragazzi finiscono in una misteriosa casa che alla fine scoprono essere una allucinazione causata da Devimon. Devimon frammenta l'isola di File in diverse isole più piccole, separando così i ragazzi su diverse isole. Devimon va vicino a catturare Tai, tuttavia il Digivice del ragazzo libera Leomon, che inizia a combattere contro Devimon per dare a Tai il tempo di fuggire, anche a costo di essere catturato nuovamente dal Digimon malvagio.
Il cuore caldo di Frigimon
Il guardiano Centarumon
Mimi e Palmon vengono infastidite da Sukamon e Chuumon. Dopo essere riuscite a sfuggire ai due Digimon, le due riescono ad andare su un'altra isola, sulla quale sono atterrati anche Izzy e Tentomon, intenti a decifrare dei geroglifici presenti in alcune rovine che i due hanno scoperto. Dopo la riunione dei due gruppi, Mimi va via, infuriata del fatto che Izzy non le presti attenzione, e Tentomon la segue, finendo col perdersi in un labirinto presente all'interno delle rovine. Izzy riesce a guidare i due tramite il suo computer portatile, ma la ragazza ed il Digimon vengono attaccati da Centarumon. Izzy e Palmon riescono finalmente a trovare i rispettivi partner e a combattere tutti insieme contro Centarumon, distruggendo l'Ingranaggio Nero che lo controlla. Dopo la battaglia, Leomon fa la sua comparsa ed attacca i bambini prescelti, ma viene respinto da Centarumon e dalla luce dei Digivice dei ragazzi.
Bakemon, spirito danzante
Portati alla deriva dal mare, Joe e Gomamon vengono attaccati da Ogremon. Gomamon digievolve Ikkakumon e sconfigge il Digimon, che è costretto a fuggire. Joe cade in mare e rischia di annegare e Gomamon, stremato dalla battaglia, non riesce a salvarlo. Sora e Biyomon salvano i loro amici, soccorrendoli dalla costa di un'isola. Gomamon si riprende e, con Sora e Biyomon, decide di nominare Joe capo del gruppo, per infondergli coraggio ed autostima. Una volta che anche Joe si riprende, i quattro raggiungono una chiesa, dove vengono fatti prigionieri dai Bakemon, Digimon simili a fantasmi. Biyomon e Gomamon digievolvono per sconfiggere Lord Bakemon, la fusione tra tutti i Bakemon presenti, ma è Joe a salvare la situazione con un canto giapponese, tradizionalmente usato per scacciare i fantasmi.[Note 3] I Bakemon vengono poi sconfitti da Ikkakumon e Birdramon che, alla fine della battaglia, trasportano rispettivamente Joe e Sora lontano dall'isola infestata.
Io e Patamon
TK e Patamon, ancora separati dal resto del gruppo, giungono nella Città della Rinascita, il posto dove nascono tutti i Digimon. Arrivati lì, vengono affrontati da Elecmon, guardiano dei piccoli Digimon e delle Digiuova. Elecmon sfida Patamon, avendo scambiato i due per intrusi. Per evitare un combattimento, TK propone che i due, per mettere fine alle ostilità, si sfidino al tiro alla fune. Patamon vince e si guadagna il rispetto e la fiducia di Elecmon. Tuttavia, Leomon ed Ogremon si stagliano minacciosi alle porte della Città della Rinascita.
Finalmente tocca a Patamon!
Attraverso l'oceano
Etemon e la prima Digipietra
Whamon accompagna i ragazzi ed i Digimon fino alle coste di Server. Agumon sente l'odore di Koromon, sua forma precedente. Tuttavia, il gruppo s'imbatte nei Pagumon, non nei Koromon. I Digimon dei ragazzi sono insospettiti, ma i Pagumon offrono al gruppo cibo in abbondanza ed un alloggio. Intanto, Poyomon digievolve Tokomon. Di notte, tuttavia, Tokomon viene rapito dai Pagumon, che lo portano in un nascondiglio segreto, dietro ad una cascata, sorvegliata dai Gazimon. I Pagumon fingono di cercare Tokomon, ma Agumon trova realmente lui e moltissimi Koromon. I Gazimon combattono con Agumon, ma Tai e gli altri lo raggiungono. Tuttavia, arriva anche Etemon, malvagio Digimon simile ad una scimmia che si ritiene un cantante provetto e, con la sua musica, sottrae energia ai Digimon dei ragazzi. I Koromon conducono il gruppo verso una via segreta, dove Tai trova la sua Digipietra, quella del Coraggio.
Greymon contro Etemon
Il capitano Kokatorimon
Piximon, il mago
Datamon e il labirinto
Il momento giusto
Ritorno a casa
L'astuto DemiDevimon
Un grande amico!
Il trionfo di MegaKabuterimon
Il re tiranno
Tai, Joe ed i rispettivi Digimon giungono in un castello, dove trovano Mimi, la quale è trattata come una principessa dai Gekomon e dagli Otamamon, che affermano che soltanto lei, con il suo canto, è in grado di risvegliare il loro re ShogunGekomon. Quando Tai e Joe provano a farle cambiare idea e a portarla con loro con un trucco, Mimi li fa imprigionare. Grazie a Sora, durante la notte, Mimi si accorge del suo cambiamento e del suo comportamento riprovevole e, dopo aver chiesto scusa a tutti, inizia a cantare. I Gekomon e gli Otamamon avevano ragione: ShogunGekomon si sveglia, ma si infuria per essere stato svegliato durante un sogno che gli piaceva molto. ShogunGekomon distrugge il palazzo ed attacca i Gekomon, gli Otamamon ed i ragazzi. Mimi, in pericolo, viene salvata da Togemon. MetalGreymon, invece, riesce a sconfiggere ShogunGekomon.
Garudamon, ali gloriose!
Il castello incantato
Gennai appare improvvisamente ed informa i ragazzi dell'esistenza di un ottavo Digiprescelto, che vive anch'esso in Giappone, e che Myotismon sta progettando di andare nel mondo reale con un'armata di Digimon malvagi per trovarlo/a. I Digiprescelti riescono ad intrufolarsi nel castello di Myotismon per cercare di fermare il suo tentativo di aprire un passaggio che gli permetterà di accedere direttamente al mondo reale, più precisamente a Tokyo. Tuttavia, i ragazzi vengono rallentati da Gatomon, tirapiedi di Myotismon, che anima diverse statue di Devidramon per costringerli a combattere. Poco prima che il portale si chiuda, Gatomon raggiunge Myotismon e giunge anch'ella a Tokyo, facendo in modo che il gruppo dei Digiprescelti rimanga a Digiworld.
Di corsa verso il Giappone!
Strane coincidenze
Viaggio verso casa
I Digiprescelti hanno una serie di disavventure nel tentativo di tornare a casa, a Odaiba. I ragazzi prendono la metropolitana, mentre i loro Digimon fingono di essere dei pupazzi. Purtroppo, durante il viaggio, i ragazzi si addormentano, saltando la loro fermata. Riescono tuttavia ad ottenere un passaggio in un furgone. L'autista, accidentalmente, spinge Izzy da un ponte. Grazie all'intervento di Motimon, digievoluto Tentomon, riesce a salvarsi. Intanto, nel fiume sottostante il ponte, appare il malvagio Gesomon, ma Ikkakumon riesce a sconfiggerlo. Successivamente, il Digimon trasporta i ragazzi verso casa.
Il mostro di fango
Battaglia alla torre di Tokyo
Gli avvistamenti di vari Digimon giunti sulla Terra sono ormai sulla prima pagina di tutti i giornali ed alla televisione, a Tokyo, non si parla d'altro. Tai e gli altri si dividono in coppie per cercare l'ottavo Digiprescelto: Tai ed Izzy, Matt e TK, Sora e Mimi. Joe, intanto, resta a casa a telefonare a tutti i ragazzi che abitavano ad Hikarigaoka per cercare degli indizi. I gruppi iniziano a perlustrare Hikarigaoka e Shibuya, mentre Gatomon incontra Kari: il Digimon si chiede se sia proprio lei l'ottavo Digiprescelto. Sora e Mimi vanno sulla Torre di Tokyo, venendo assalite da SkullMeramon. Birdramon e Togemon provano a rallentarlo, ma sono troppo deboli. Tai ed Izzy arrivano in soccorso mentre SkullMeramon cerca di spezzare in due la torre e Kabuterimon interviene per non farla cadere. Intanto, Greymon superdigievolve MetalGreymon e sconfigge SkullMeramon.
Due Digimon nella città dei bambini
Il misterioso destino di Gatomon
Gatomon continua a seguire Kari, ma nemmeno il Digimon riesce a spiegarsene il motivo. Wizardmon, servo di Myotismon, trova l'ottavo Digivice, ma lo consegna a Gatomon: i due sono amici da molto tempo. Wizardmon ricorda che Gatomon, un tempo, gli disse che stava cercando qualcuno, ma non riusciva a ricordarsi chi fosse. Quindi la porta da Kari e fa incontrare la bambina ed il Digimon, rivelando ciò che era ormai palese: Kari è l'ottavo Digiprescelto e Gatomon è in realtà il suo Digimon partner. Wizardmon e Gatomon vanno quindi alla ricerca dell'ottavo Digimedaglione con relativa Digipietra della Luce, che però Myotismon tiene con sé. Il Digimon malvagio prende atto del tradimento dei due ed inizia a combattere contro Wizardmon e poi contro Greymon, intervenuto insieme a Tai dopo essersi accorto del combattimento. Tuttavia, il combattimento termina in favore del Digimon malvagio, che cattura Gatomon e ferisce molto gravemente Wizardmon, per poi scappare.
La nebbia si dirada...
Tutti per uno...
Una grande scoperta
Pronti a tutto!
Gennai parla ai ragazzi di una profezia che potrebbe salvare il Mondo reale e quello dei Digimon, ma prima Izzy e gli altri devono essere in grado di decifrarla. Intanto, dei pipistrelli attaccano tutti i Digimon di Myotismon e, assorbiti i dati di tutti, compreso DemiDevimon, si fondono insieme, creando VenomMyotismon. Patamon e Gatomon digievolvono Angemon e Angewomon e tutti gli altri Digimon digievolvono a loro volta, sperando di fermare VenomMyotismon. Angemon ed Angewomon, dopo che il gruppo riesce a decifrare la profezia, lanciano, rispettivamente, la Freccia della Speranza verso Matt e quella della Luce verso Tai, permettendo così a Gabumon ed Agumon di megadigievolvere in MetalGarurumon e WarGreymon.
Due mondi uniti
Un nuovo mondo!
La vendetta di MetalSeadramon
I Digiprescelti fanno ritorno sulla spiaggia dove combatterono Shellmon, che li attacca nuovamente su ordine di MetalSeadramon. Tuttavia, senza bisogno di digievolvere, i Digimon di livello intermedio riescono a sconfiggerlo: sono molto più forti ora. MetalSeadramon invia un altro suo scagnozzo, Scorpiomon. Scorpiomon e MetalSeadramon per poco non uccidono i ragazzi, ma Lillymon e Zudomon salvano i Digiprescelti. Tai e gli altri iniziano a dubitare delle capacità dei loro compagni Digimon rispetto a quelle dei Padroni delle Tenebre. MetalSeadramon, intanto, torna alla carica e Lillymon si ferma per permettere la fuga dei ragazzi, trasportati via da Zudomon. Solo grazie all'intervento di Whamon i Digiprescelti ed i loro Digimon riescono a scappare dal Padrone delle Tenebre.
Grazie Whamon!
Un gioco pericoloso!
Il misterioso Cherrymon
WarGreymon contro MetalGarurumon
Matt e Tai iniziano a litigare: Matt vuole andarsene per sempre dal gruppo. Intanto, WarGreymon e MetalGarurumon iniziano a combattere. Era questo il piano iniziale di Cherrymon ma, improvvisamente, un'entità amichevole entra nel corpo di Kari. I ragazzi, con i loro Digimon, iniziano a volare. "Kari" inizia a spiegare ai ragazzi i motivi per cui vennero originariamente scelti per andare a Digiworld e che ogni Digimedaglione rappresenta la qualità migliore di ogni Digiprescelto. Al termine della storia, Kari ritorna in sé, mentre Matt decide di rimanere solo e se ne va nuovamente. Anche Mimi decide di separarsi dal gruppo: non vuole combattere contro i Padroni delle Tenebre ed essere causa della morte di altri Digimon. Joe decide di restare con lei, stanco di dover lottare e desideroso di proteggere Mimi.
La vendetta di Etemon
Addio Leomon
Kari in pericolo
La fine di Machinedramon
Donne guerriere
Tai, Izzy e Kari sono costretti ad affrontare la potente LadyDevimon, seguace di Piedmon, che inizia un combattimento estenuante con Angewomon, mentre Sora e TK vanno in cerca degli altri. Angewomon, nonostante faccia del suo meglio, sembra avere inizialmente la peggio. Joe e Mimi incontrano nella Città della Rinascita Elecmon, al quale i due chiedono di appoggiare la loro causa. Ma, improvvisamente, Joe annuncia che lui e Gomamon stanno per lasciare temporaneamente il gruppo per andare a cercare Matt e Gabumon. Nel frattempo, con l'aiuto di MegaKabuterimon che para un colpo mortale destinato ad Angewomon ma che ne esce illeso grazie alla sua dura corazza, il Digimon angelico riesce a sconfiggere LadyDevimon. Dopo la sconfitta del Digimon, è Piedmon a minacciare il gruppo e WarGreymon si prepara ad affrontarlo in un combattimento uno contro uno.
Quando il gioco si fa duro...
La fine di Piedmon
Apokarimon
Addio ad un mondo nuovo!
Ritorno a Digiworld
L'apertura del Digivarco
Le Digiuova in azione
Gli Obelischi di Controllo
Il ritorno di Joe
Gomamon si trova nel settore del ghiaccio di Digiworld, dove l'Imperatore sta costruendo una prigione. Dopo aver schiavizzato molti Gizamon e Frigimon (insieme ad uno Shellmon e ad un Ebidramon), fa attaccare Gomamon. Il Digimon, in pericolo, chiede aiuto a Joe e ai nuovi Digiprescelti, che accorrono. Alla fine i Digiprescelti distruggono un altro Obelisco di Controllo, liberando un settore appena conquistato dall'Imperatore, mentre Cody e Joe si avvicinano e divengono amici grazie all'esperienza vissuta insieme.
Un picnic pericoloso
I Digiprescelti stanno per andare a Digiworld per fare un picnic ed incontrano Mimi, che si è trasferita in America ma è tornata in Giappone per un breve periodo per il matrimonio di sua cugina, e si unisce a loro. A Digiworld però Mimi, Yolei e Hawkmon si allontanano dal gruppo e si ritrovano in un settore dell'Imperatore dove trovano Palmon. Le ragazze, attaccate dai fratelli Roachmon controllati dall'Imperatore, riusciranno a distruggere un Obelisco grazie ad Halsemon, dando la possibilità a Palmon di digievolvere Togemon liberando il settore e stringendo un forte legame d'amicizia.
I custodi della libertà
I Digiprescelti continuano a distruggere incessantemente gli Obelischi di Controllo, ma durante una missione Kari rimane intrappolata a Digiworld. TK e Davis con i loro digimon tornano indietro per salvarla, in assenza di obelischi TK permette a Patamon di digievolvere Angemon che riesce a farli entrare e improvvisamente sopraggiunge anche Andromon, una vecchia conoscenza di Tai e Kari, che è però controllato dall'Imperatore. Kari, tuttavia, riesce a risvegliare i veri sentimenti di Andromon, che si libera dell'Anello del Male e distrugge l'Obelisco. L'Imperatore, intanto, è impegnato a trovare un modo per sottomettere alla sua volontà anche i Digimon di livello evoluto, sui quali l'influenza dell'Anello del Male non è sufficiente.
Rivelazioni
La squadra di Davis gioca una partita di calcio contro quella di Ken Ichijouji ed il ragazzo durante la partita ferisce lievemente alla gamba il suo neo-rivale. Nel frattempo, a Digiworld, l'Imperatore Digimon ha costruito un nuovo Obelisco e i Digiprescelti accorrono per distruggerlo. L'Imperatore però prende in ostaggio i ragazzi, esclusi Davis e Veemon, ai quali viene data la possibilità di scegliere di salvare uno solo tra i loro otto amici, ma i due non riescono a decidere. In realtà, però, i ragazzi erano alcuni Bakemon travestiti, mentre i veri Digiprescelti ed i loro partner accorrono per sconfiggere i nemici e distruggere l'Obelisco. Durante il confronto di Davis con l'Imperatore, quest'ultimo rivelerà la sua vera identità, anche a causa di una strana ferita alla gamba notata da Davis: si tratta di Ken Ichijouji.
Un amico fra i nemici
I Digiprescelti, sconvolti dalle rivelazioni sull'Imperatore Digimon, cercano Ken per parlargli, tuttavia il ragazzo pare scomparso. Ken si trova infatti a Digiworld, dove ha deciso di trasferirsi definitivamente, e ha riconquistato parecchi settori. Inoltre rapisce Greymon e gli mette l'Anello del Male. I Digiprescelti tornano a Digiworld per combattere l'Imperatore, che cerca di far digievolvere Greymon in MetalGreymon, ma il Digimon, dominato dalle forze del male, digievolve SkullGreymon e si rivolta contro l'Imperatore. SkullGreymon, sfinito, ritorna Agumon e viene rapito nuovamente dall'Imperatore, che conquista così numerosi settori che erano sotto la protezione di Greymon.
MetalGreymon alla carica
Mentre l'Imperatore tenta degli esperimenti per far digievolvere Agumon in MetalGreymon facendolo rimanere al contempo sotto il suo controllo, i Digiprescelti, esclusa Yolei che sembra non sentirsela, tornano a Digiworld per ritrovare Agumon, il quale nel frattempo viene liberato da Wormmon, il Digimon partner di Ken, che non approva il comportamento del suo Digiprescelto. I Digiprescelti ritrovano Agumon, ma vengono raggiunti dall'Imperatore che, con la Spirale del Male (una versione migliorata dell'Anello del Male), riesce a riprendere il controllo di Agumon e a farlo digievolvere correttamente in MetalGreymon. Tai rimane sconvolto, ma torna in sé grazie all'aiuto di Matt e, insieme agli altri Digiprescelti (a cui si è aggiunta Yolei), cerca di ritrovare MetalGreymon per salvarlo.
Raidramon, tuono blu
I Digiprescelti sono costretti a scontrarsi con MetalGreymon, ormai sotto il controllo dell'Imperatore, ma durante la battaglia Davis si trova in difficoltà. Il ragazzo non vuole ferire MetalGreymon, ma quando vede Matt affrontare il Digimon con Garurumon capisce il grande legame che Tai e gli altri hanno sviluppato con i loro Digimon, cosa che lo fa sentire inadeguato. Ciò risveglia il Digiuovo dell'Amicizia, trovato poco prima dal gruppo ma che nessuno era riuscito a prendere: ciò permette a Veemon di armordigievolvere in Raidramon, grazie al quale Agumon viene liberato dalla Spirale del Male.
Sfida al Digimon Corral
Biyomon si trova in difficoltà e chiede aiuto a Sora e ai Digiprescelti, che accorrono (senza TK, Kari, Patamon e Gatomon che non si accorgono della richiesta di aiuto). A Digiworld i ragazzi vengono coinvolti loro malgrado in alcune liti fra Starmon (controllato dall'Anello del Male) e Deputymon, ma riescono a trovare Biyomon. Alla fine, grazie a Flamedramon, i ragazzi liberano Starmon dall'Anello del Male e liberano il settore dall'ennesimo Obelisco di Controllo.
Una strana sensazione
Kari scompare improvvisamente e finisce per ritrovarsi in un mondo oscuro e sconosciuto, dal quale era stata irresistibilmente attratta, popolato da alcuni Digimon acquatici, i Divermon, che vorrebbero liberarsi dalla Spirale del Male e che hanno chiamato Kari sperando che lei potesse aiutarli. All'improvviso un Airdramon attacca Kari. Con l'aiuto di TK, Pegasusmon e Gatomon, che erano infine riusciti a trovare la ragazza, Airdramon viene sconfitto grazie alla Superdigievoluzione di Gatomon in Angewomon, mentre i Divermon vengono liberati e chiedono a Kari di diventare la loro sposa, per riprodursi e sopraffare l'Imperatore, ma al suo rifiuto i Digimon tornano nelle acque dominate dal loro vecchio padrone. Costui è Dragomon, un potentissimo digimon, e Kari, senza saperlo, quindi, è finita nel Mare Oscuro di Dragomon.
Shurimon guerriero veloce
A Digiworld i Digiprescelti incontrano Mimi e conoscono un suo amico americano, Michael, anch'egli un Digiprescelto, il quale piace immediatamente a Yolei, che paga loro il pranzo consumato al ristorante di Digitamamon. Il gruppo viene però improvvisamente attaccato dallo stesso Digitamamon controllato da una Spirale del Male dell'Imperatore. Yolei, dopo aver confessato i suoi veri sentimenti provati in quel momento, attiva il Digiuovo della Sincerità, che permette ad Hawkmon di armordigievolvere Shurimon e di sconfiggere velocemente Digitamamon.
La sfida
I Digiprescelti devono liberare un altro settore soggiogato dall'Imperatore. Shurimon viene quindi sfidato da Ninjamon, Digimon esperto di shuriken che si vanta di essere il più forte Digimon ninja e vuole dimostrarlo. Ninjamon, inoltre, mette anche la Spirale del Male a ShogunGekomon, il Digimon capo di quel settore, scatenando la sua furia. Shurimon riesce alla fine a battere Ninjamon ed i bambini prescelti liberano il settore dall'ingombrante presenza dell'Imperatore Digimon.
Prigionieri negli abissi
Mentre sono alla ricerca di un altro Digiuovo, i Digiprescelti vengono intrappolati negli abissi da MegaSeadramon. Nella stazione petrolifera in cui sono prigionieri, i ragazzi trovano una capsula e con essa fanno tornare Cody in superficie per chiedere aiuto. Cody va a cercare Joe per salvare i suoi amici, mentre gli altri riescono a trovare il Digiuovo. Alla fine i ragazzi vengono raggiunti da Cody, Joe e Ikkakumon ma Cody, dopo una crisi interiore causata dall'aver mentito a suo nonno, decide di non volere il Digiuovo dell'Affidabilità perché crede di non meritarlo. Joe gli spiega che quando una bugia permette di salvare la vita ai propri amici è innocua. Cody torna in sé, prende il Digiuovo dell'Affidabilità e permette ad Armadillomon di armordigievolvere in Submarimon, che sconfigge MegaSeadramon e lo libera dalla Spirale del Male.
L'anniversario
I Digiprescelti festeggiano la terza ricorrenza del primo agosto, ovvero il giorno in cui Tai e gli altri andarono a Digiworld per la prima volta. Intanto, un misterioso fantasma scatena il panico nello studio televisivo di Tokyo dove lavora il padre di Matt, il quale è in cerca di Gatomon. I Digiprescelti scopriranno che si tratta del fantasma di Wizardmon, il quale mette in guardia con parole criptiche la sua amica Gatomon ed il gruppo dei Digiprescelti riguardo ad un pericolo imminente.
La base dell'Imperatore
Cody, Izzy e i loro Digimon trovano la base dell'Imperatore e, con tutti i Digiprescelti, decidono di sferrare un attacco per sconfiggere definitivamente l'Imperatore. Yolei è turbata dal fatto che la battaglia sta diventando più dura e per questo nella missione mette inavvertitamente in pericolo Hawkmon, che viene ferito. La base dell'Imperatore sembra essere scomparsa e così Davis, Cody, TK e i loro Digimon la cercano. L'Imperatore nel frattempo sta preparando qualcosa e all'improvviso la sua fortezza volante compare nel cielo e viene avvistata da Kari, Yolei e dai loro Digimon. La battaglia finale con il nemico è alle porte.
Il super Digimon
L'Imperatore, dopo aver recuperato da un misterioso vortice delle informazioni preziose riguardanti il perfido Devimon, riesce ad ultimare il suo progetto: il terribile Kimeramon, assemblato con parti di diversi Digimon, così da assumerne tutti i punti di forza. Il super Digimon si scontra quindi con Nefertimon, Pegasusmon e Halsemon e li costringe alla ritirata, dimostrandosi un Digimon imbattibile.
Il Digiuovo dei Miracoli
L'Imperatore, grazie a Kimeramon, sta conquistando tutta Digiworld. Per fermarlo i Digiprescelti si introducono nella fortezza dell'Imperatore ma devono scontrarsi con Kimeramon, che li sconfigge. La situazione peggiora quando le forze del male prendono il sopravvento e Kimeramon si ribella all'Imperatore. Wormmon, per salvare Ken, decide di aiutare Davis portandolo alla fonte di energia della fortezza dell'Imperatore al fine di disattivarla. Incredibilmente, però, la fonte di energia della fortezza si rivela essere il Digiuovo dei Miracoli, che Davis usa per far armordigievolvere Veemon in Magnamon.
Il coraggio di Wormmon
Una difficile Digievoluzione
I ragazzi, dopo aver sconfitto l'Imperatore Digimon, tornano a Digiworld per riparare i danni causati dalla crisi dell'Imperatore stesso. Davis, per attirare su di sé l'attenzione di Kari ed invidioso di TK ed Angemon, cerca di far digievolvere Veemon. Alla fine riuscirà nel suo intento dopo diverse disavventure con un Tortomon e Veemon digievolverà in ExVeemon.
Di nuovo insieme
Questo episodio è totalmente incentrato sul personaggio di Ken Ichijouji. Ken, tornato a casa dopo essersi spogliato dei panni dell'Imperatore Digimon, non riesce a darsi pace per la perdita di Wormmon e ripensa a suo fratello Osamu, perso anni prima in un incidente, e al primo incontro con Wormmon. Ken non riesce a capire le ragioni di tutto il male che si è generato da lui. Il ragazzo alla fine ricorda una frase sul ciclo vitale dei Digimon e capisce che il suo Digimon potrebbe tornare da lui. Ken rientra quindi a Digiworld e si reca alla Città della Rinascita, dove cerca il Digiuovo di Wormmon, venendo nel mentre insultato da tutti i Digimon di livello primario già nati che si trovano lì. Dopo una dichiarazione di colpa sul dolore causato al suo Digimon, Ken vede un Digiuovo brillare e da quell'uovo nasce Leafmon, la forma al livello primario di Wormmon. Ken torna quindi a casa, dove si riconcilia definitivamente con i suoi genitori.
Un salvataggio inatteso
Una donna misteriosa fa visita a Ken nella sua stanza, dicendogli che ora non ha più bisogno di lui. A Digiworld intanto, i ragazzi, ancora impegnati nella ricostruzione dei vari settori, si accorgono che i Digimon non riescono a digievolvere, forse a causa di un Obelisco non ancora abbattuto vicino alla cittadina. Cody e Digmon vengono improvvisamente attaccati da Thunderballmon e, per salvare Cody, Armadillomon digievolve in Ankylomon. Cody però viene salvato da Stingmon, Digievoluzione di Wormmon, mentre Ankylomon sconfigge il nemico. Thunderballmon, però, viene infine eliminato da Stingmon per la disapprovazione di gran parte del gruppo dei Digiprescelti. L'Obelisco intanto sembra misteriosamente scomparso e Ken e Wormmon si ritirano, mentre Cody cerca di capire perché Ken l'abbia aiutato.
Aquilamon la regina dei cieli
L'unione fa la forza
I Digiprescelti scoprono grazie a Izzy che l'ex-fortezza dell'Imperatore Digimon sta per esplodere e che se ciò accadesse verrebbe sprigionata una grande quantità d'energia oscura che sarebbe estremamente deleteria per l'instabile equilibrio di Digiworld. L'unico modo per evitare l'esplosione è posizionare la Digipietra della Bontà di Ken in sostituzione del Digiuovo dei Miracoli; tuttavia, i Digiprescelti vengono ostacolati dalla donna misteriosa, che crea un Okuwamon, un potentissimo Digimon formato da più obelischi. Intanto Ken prende contatto con la donna, che gli rivela di essere stata lei a farlo diventare l'Imperatore allo scopo di fargli costruire più obelischi possibili. Ken vorrebbe sacrificarsi per salvare la situazione, ma Davis riesce a persuaderlo ed i due sembrano comprendersi a vicenda scatenando una Digievoluzione molecolare fra ExVeemon e Stingmon, che insieme diventano Paildramon.
Il segreto svelato
Paildramon e Okuwamon iniziano uno scontro mentre i Digiprescelti cercano di fermare l'esplosione. Alla fine Okuwamon viene sconfitto e l'esplosione viene evitata grazie all'intervento di Paildramon. Izzy mette al corrente i Digiprescelti della Digievoluzione molecolare da cui scaturì Omnimon, mentre Ken è ancora indeciso se unirsi agli altri o meno nonostante gli eventi appena occorsi.
Il flauto incantatore
I Digiprescelti stanno radendo al suolo incessantemente gli Obelischi di Controllo e la donna misteriosa, infuriata, propone loro una sfida alla Giga House, un'enorme casa che si trova a Digiworld. Ma una volta lì i Digiprescelti, accompagnati anche da Ken e Wormmon, vengono attaccati da un esercito di Digimon insetto, controllati dalla donna misteriosa grazie ad un flauto incantatore. Digmon e Stingmon, essendo anch'essi Digimon di tipo insetto, cadono sotto il controllo della donna ed attaccano ExVeemon, mentre Davis, Ken e Cody rimangono bloccati sulla ragnatela di un Dokugumon.
Suoni e ultrasuoni
I Digiprescelti riescono a neutralizzare il suono del flauto incantatore con degli ultrasuoni creati con un computer della Giga House. Finalmente la donna misteriosa rivela la sua vera identità: in realtà è Arakenimon, un Digimon dalle sembianze di ragno. Paildramon lotta contro di lei e sta per batterla, quando entra in scena anche Mummymon, un Digimon simile ad una mummia, che salva Arakenimon e fugge con lei.
100 Obelischi di Controllo
I Digiprescelti continuano con la distruzione degli Obelischi. Cody e Ken non riescono a socializzare e per l'imbarazzo finiscono con l'ignorarsi, mentre Arakenimon crea, grazie all'ausilio di cento Obelischi di Controllo, BlackWarGreymon, una versione oscura di WarGreymon. Questo Digimon è potentissimo e riesce a sconfiggere anche Paildramon; tuttavia, il Digimon sembra dotato di libero arbitrio e non segue gli ordini di Arakenimon e Mummymon, finché non decide di abbandonarli per andare alla ricerca di un degno avversario.
L'Anello Sacro
I Digiprescelti si dividono in gruppi per ritrovare l'Anello Sacro di Gatomon, smarrito dal Digimon durante la fuga dall'Imperatore Digimon. Yolei, Kari e i loro Digimon incontrano Ken, in preda a misteriosi flashback, e Wormmon. I tre finiscono in un settore dove lo spazio è distorto e allora Arakenimon ne approfitta per sferrare un attacco ai suoi nemici, inviandogli contro Blossomon, ennesimo Digimon creato con gli Obelischi. Yolei e Kari, che durante l'episodio avevano dato prova di non riuscire a comprendersi appieno reciprocamente, durante la battaglia (che vede Stingmon, Gatomon e Aquilamon in seria difficoltà) riescono a creare un rapporto tale che permette la digievoluzione molecolare fra Aquilamon e Gatomon in Silphymon, il quale riesce a battere il forte avversario.
Se avessi un cuore
BlackWarGreymon si chiede se possieda un cuore e si interroga sul motivo della sua esistenza. Il Digimon improvvisamente incontra Agumon, che cerca di dargli delle risposte e di stringere amicizia con lui. Intanto i Digiprescelti lottano contro Knightmon, nuovo Digimon di Arakenimon e Mummymon, che cerca di distruggere una delle Pietre Sacre che mantengono l'equilibrio di Digiworld. Quando Knightmon scalfisce la Pietra, BlackWarGreymon, in preda di una strana forza, distrugge il Digimon, sconfigge i Digiprescelti e distrugge infine la Pietra.
La città dei folletti
Yolei è in gita con la sua classe a Kyoto ed affida Poromon a Izzy, che nel frattempo cerca di colmare i vuoti di memoria di Ken e di trovare una spiegazione alla sua trasformazione nell'Imperatore. Intanto, BlackWarGreymon continua a distruggere le Pietre Sacre, creando dei disturbi temporali che portano lui e altri Digimon nel mondo reale, proprio a Kyoto, dove creano il caos. Tuttavia, Yolei riuscirà a tenerli a bada con Shurimon (arrivato a Kyoto grazie a Ken e Stingmon), aiutata dal padre di Sora e dal fratello di Joe, incontrati durante la gita.
Salviamo le Pietre Sacre!
BlackWarGreymon continua a distruggere le Pietre Sacre, mentre Cody cerca di capire il comportamento ed i sentimenti di TK, in previsione di una possibile DNAdigievoluzione tra i loro Digimon. I Digiprescelti tentano di salvare una Pietra Sacra da BlackWarGreymon e Angemon, grazie all'energia della Pietra Sacra, superdigievolve MagnaAngemon, cercando immediatamente di risucchiare il nemico all'interno del suo Varco Soprannaturale. Ciò nonostante, Blackwargreymon riesce a distruggere la Pietra con un ultimo tentativo disperato e MagnaAngemon regredisce in Patamon, mentre BlackWarGreymon vola via per continuare la caccia alle Pietre Sacre.
Il coraggio di Cody
Cody non riesce a comprendere come mai TK odi così profondamente le tenebre e si reca da Matt, suo fratello, per avere delle spiegazioni. Così Matt racconta a Cody di come Angemon si sacrificò per sconfiggere Devimon e di come TK rimase sconvolto nel vedere il suo Digimon regredito in un semplice Digiuovo. BlackWarGreymon intanto continua la sua ricerca delle Pietre Sacre e trova la penultima; tuttavia in sua difesa vi si schiera Cody, chiedendo a BlackWarGreymon se abbia veramente un cuore. BlackWarGreymon non sa cosa rispondere e alla fine decide di non avere un cuore, ritenendolo inutile, distruggendo poi la Pietra Sacra.
L'ultima Pietra Sacra
Arakenimon e Mummymon arrivano nel quartiere cinese di Digiworld e decidono di pranzare nel ristorante cinese di Digitamamon. Anche i Digiprescelti sostano nello stesso ristorante e cominciano a combattere con i due Digimon nemici. Purtroppo, i Digimon sono senza energie e non riescono a completare la Digievoluzione molecolare, lasciando che Arakenimon e Mummymon si diano alla fuga. Invece di inseguirli, i ragazzi, invitati da Cody che poco prima era stato l'unico a non essere d'accordo con la sosta, decidono di mangiare qualcosa per recuperare le forze. Nel frattempo, in un bosco lì vicino, Mummymon trova l'ultima Pietra Sacra e BlackWarGreymon e i Digiprescelti giungono sul posto. Paildramon e Silphymon cercano di fermare BlackWarGreymon, ma sembra tutto inutile. A questo punto, Cody e TK provano la Digievoluzione molecolare e da Ankylomon e Angemon nasce Shakkoumon.
Una nuova minaccia
La festa di Natale
La nascita di Imperialdramon
Viaggio in America e a Hong Kong
Matt, Ken e Davis vanno in America, ma i primi due deviano poi verso il Messico. Davis si reca invece a New York, dove si riunisce a Mimi, reincontra poi Michael e facendo la conoscenza dei Digiprescelti americani, riportando la situazione alla normalità con l'aiuto di Ex-Veemon. Kari e Izzy, invece, si recano ad Hong Kong, dove, dopo aver ottenuto la fiducia dell'esercito cinese, e grazie a MegaKabuterimon ed Angewomon rimandano a casa i Digimon.
Viaggio in Australia e in Francia
Sotto il caldo sole australiano, Cody e Joe, aiutati da Derek e dai Digiprescelti locali, e da Submarimon e Zudomon rimandano a Digiworld dei Digimon di tipo acquatico. Invece Tai e TK, giunti in Francia, ricevono aiuto dallo zio francese di TK e da MetalGreymon ed MagnaAngemon per liberare una Digiprescelta tenuta prigioniera a Versailles.
Viaggio in Messico e in Russia
Ken e Matt si recano in Messico, dove, oltre a dover aiutare una piccola Digiprescelta, devono anche salvaguardare antiche costruzioni storiche dai Digimon arrivati da Digiworld. E grazie a WereGarurumon e Stingmon superano la missione. Sora e Yolei, nonostante i problemi di lingua, riescono a collaborare con dei Digiprescelti russi, anche combattendo con Garudamon e Aquilamon le condizioni sono troppo sfavorevoli e le due finiscono per perdere. Vengono però salvate da Imperialdramon, che torna per riportarle a casa ma le scopre in difficoltà. Sistemata la questione, i Digiprescelti tornano a casa, giusto in tempo per festeggiare il Natale. Tuttavia, Arakenimon ha ancora in mente qualcosa.
L'avversario
SkullSatamon, MarineDevimon e LadyDevimon arrivano nel mondo reale, spargendo caos e distruzione. I Digiprescelti si trovano in difficoltà, ma Imperialdramon, grazie all'energia di Aquilamon, Ankylomon, Angemon ed Angewomon, diventa in grado di accedere al suo Assetto da Combattimento, sconfiggendo SkullSatamon. All'improvviso compare Demon, signore delle tenebre e capo dei tre Digimon, il quale desidera che Ken lo segua. Tuttavia, anche Arakenimon e Mummymon vogliono che Ken li segua, costringendolo a farlo per non mettere in pericolo dei bambini che i due hanno rapito. Così, Ken finisce prigioniero dei due Digimon.
Il segreto del successo
Una volta prigioniero di Arakenimon e Mummymon, Ken scopre che i due Digimon sono comandati da un essere umano, Yukio Oikawa, ex collega di suo padre, che gli rivela di essere a conoscenza della fonte dei suoi guai. È il Seme delle Tenebre, impiantato nel suo corpo durante il suo primo viaggio a Digiworld. Il Seme delle Tenebre è un insieme di dati che migliorano le facoltà fisiche e intellettive di chi lo possiede, ma lo trasforma in un essere senza scrupoli, come Ken, che in questo modo è diventato l'Imperatore Digimon. Oikawa trasferisce il seme da Ken agli altri bambini, che vogliono diventare bravi in tutto proprio come il loro eroe. Intanto, Shukkoumon e Silphymon combattono e sconfiggono dopo varie peripezie rispettivamente MarineDevimon e LadyDevimon. Davis raggiunge Ken e i nemici, i quali vengono fermati dall'arrivo di Demon, desideroso anch'egli di entrare in possesso del Seme delle Tenebre per i suoi scopi.
Arco di Oikawa
Oikawa, ottenuto ciò che voleva, fugge e costringe i Digiprescelti ad ingaggiare un combattimento contro Demon. Tuttavia Demon sembra imbattibile, neanche l'attacco combinato di Imperialdramon Fighter Mode, Silphymon e Shukkoumon riesce a sconfiggerlo. I Digiprescelti si rendono conto che anche rimandarlo a Digiworld sarebbe inutile, visto che Demon è in grado di aprire lui stesso un portale tra il mondo reale e quello digitale. L'unica soluzione è spedirlo in una dimensione che non è né Digiworld né il mondo reale, allora Ken, col proprio Digivice, apre un varco che scaraventa Demon nella dimensione del Mare Oscuro di Dragomon. La sera stessa, tutti i bambini con il Seme delle Tenebre tornano nelle proprie case.
Una sconfitta necessaria
Mentre i bambini con il Seme delle Tenebre cominciano a dare primi segnali di crudeltà e sadismo, BlackWarGreymon arriva nel mondo reale e cerca di sconfiggere Oikawa, che gli rivela di aver creato Arakenimon e Mummymon tramite la fusione di alcuni dati con frammenti del suo DNA, rivelandosi quindi una specie di padre per BlackWarGreymon. WarGreymon e Imperialdramon Fighter Mode successivamente combattono e sconfiggono BlackWarGreymon, che si allontana, ammettendo di essere stato felice di averli conosciuti.
Il gesto eroico di BlackWarGreymon
Oikawa scopre che Cody è il figlio del suo più grande amico, Hiroki, ormai defunto da tempo. Da bambini il loro sogno era quello di andare a Digiworld, sogno che con il raggiungimento dell'età adulta era ancora incompiuto e tale sarebbe rimasto per sempre a causa della morte di Hiroki. L'incontro con Chikara, nonno di Cody e padre di Hiroki, sconvolge Oikawa. Tuttavia, il Seme delle Tenebre di una bambina fiorisce e Oikawa, prendendolo, acquisisce un'enorme energia e colpisce mortalmente BlackWarGreymon, intervenuto per impedirgli di colpire il nonno di Cody. BlackWarGreymon, in fin di vita, decide di usare le sue ultime forze per chiudere il varco fra Hikarigaoka e Digiworld, per evitare altri disastri.
Una nuova dimensione
Oikawa si appresta a raggiungere il suo obiettivo: recarsi a Digiworld, accompagnato dai bambini contaminati dal Seme delle Tenebre. Oikawa apre un varco, che tuttavia porta loro ed i Digiprescelti (che li stavano seguendo) in un'altra dimensione, dove vengono accolti da una vecchia conoscenza di Gatomon e degli ex Digiprescelti: Myotismon. Tre anni fa, dopo essere stato sconfitto dai Digiprescelti, Myotismon approfittò della debolezza di Oikawa per la recente perdita di Hiroki ed entrò nel suo corpo per sopravvivere, promettendogli di realizzare il suo desiderio di recarsi a Digiworld. Ora Myotismon, che ha raccolto abbastanza energia, può uscire dal corpo di Oikawa, alimentato dai Fiori delle Tenebre, trasformato in MaloMyotismon. Quindi, uccide senza pietà Arakenimon e Mummymon per testare i poteri del suo nuovo corpo e si appresta a combattere i Digiprescelti.
Forza di volontà
MaloMyotismon inganna con delle illusioni i Digiprescelti, cercando di privarli del loro spirito combattivo; tuttavia, Davis se ne accorge e, dopo aver aiutato gli amici ad uscire dalle illusioni, infonde loro il suo coraggio. Trovandosi in una dimensione dove tutto è possibile, i Digimon dei sei Digiprescelti digievolvono in tutte le loro forme contemporaneamente, creando un esercito di Digimon che combattendo insieme mette in difficoltà MaloMyotismon, il quale però apre un varco che lo conduce a Digiworld, dove, grazie alla sua energia oscura, minaccia di far piombare per sempre nelle tenebre il mondo reale e Digiworld.